病菌主要以菌丝体或分生孢子在病谷、病稻草上越冬，成为翌年的初侵染源。干燥时，分生孢子可存活0.5〜la,菌丝体在病组织内可存活la以上；潮湿时经2〜3个月即死亡。翌年条件适宜时，越冬病稻草上产生分生孢子。病菌产生孢子的始期，南方较早约为3月上旬，长江流域约为3月下旬，北方约为6〜7月。分生孢子靠气流传播，引起秧田和本田的初侵染而形成中心病株。病斑上产生的分生孢子借气流传播至健株，引起再侵染。种子带菌一般只引起苗瘟，造成秧田三叶期前的死苗。
(1) 孢子附着与侵入：病菌分生孢子着落于稻株后，在有水膜的条件下，萌发形成附着胞和侵入丝，直接侵入或经伤口侵入。分生孢子的侵入率与温度和稻株体表结水时间有关，侵入叶片的最适温度为24℃,低于13℃或超过35℃时均不能侵入。
(2) 潜育期与孢子形成：潜育期长短主要受温度影响，28℃时最短。适宜条件下叶瘟潜育期一般为4〜7d,穗颈瘟为10〜14d,枝梗瘟为7〜12d,节瘟为7〜30d。另外，潜育期长短还与受侵入组织的生理日龄和寄主抗病性有关，幼嫩组织的潜育期相应缩短，抗病性品种的潜育期相应延长。病斑产孢量与发病部位、病斑类型、温度有关，最适温度为28℃,叶瘟以急性型病斑产孢量最高，穗瘟以穗颈瘟产孢量最高。分藥期叶片一个病斑上的孢子形成量最高可达4万个，感病品种的穗颈、穗轴、小穗发病后，其最高产孢量分别可达28万、6万和8万。
(3) 孢子释放与传播：风是孢子飞散的必要条件，而雨、露等能促使孢子脱离孢子梗。正常天气条件下，孢子自下午8时左右开始释放，直至翌晨日出前，释放高峰为凌晨0〜4时，其间释放的孢子量占全天释放总量的40%以上。阴雨天时，孢子可全天释放。孢子传播距离与风速呈正相关，风速越高，传播越远。但病菌孢子抗逆性较差，在远距离传播中易丧失活性。
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